2001年12月，陕西省人民政府批准设立陕西化龙山省级自然保护区，2003年4月成立化龙山省级自然保护区建设领导小组；2007年4月国务院办公厅批准晋升为国家级自然保护区，2008年3月经安康市机构编制委员会批准设立“陕西化龙山国家级自然保护区管理局”，隶属于安康市林业局管理，为财政全额拨款的正县级事业单位，县级领导1正3副，编制49人，其中：设正高级1人、副高级6人、中级12人，有陕西省“三五人才”、安康市有突出贡献专家1人。内设办公室、保护管理科、科研宣教科、森林防火办公室4个科室，八仙、上竹、牛头店、曾家、白家5个正科保护站。

主要职能：贯彻执行国家有关法律、法规、方针政策，制定自然保护区管理制度和措施，承担保护区具体管理工作；制定本保护区总体规划，承担项目编制、申报和实施工作；承担本保护区生态建设和自然资源、自然环境保护管理工作；负责本保护区内森林防火、病虫害防治和重大疫情处置及协助查处破坏森林资源案件等工作；承担和组织开展资源调查、科学研究、巡护监测工作；承担生态文明宣传教育和社区共建等工作。

主要成就：一是2018年9月1日起实施了《安康化龙山国家级自然保护区条例》，在陕西省率先实现了“一区一法”。二是编撰出版了《陕西化龙山国家级自然保护区植物资源及保护》《陕西化龙山国家级自然保护区脊椎动物资源与保护》《化龙山鸟类图鉴》等著作。三是先后被国家林业局、教育部、共青团中央授予“国家生态文明教育基地”称号；被全国绿化委员会授予“全国绿化模范单位”；被省市有关部门授予“陕西省生态文明教育基地”“陕西省青少年教育基地”称号以及“‘十一五’全省自然保护区管理先进单位”“省级卫生单位”“市级先进基层党组织”“市级文明单位”等荣誉。

合作交流：先后与陕西师范大学、陕西省动物所、西北农林科技大学、安康学院等科研院校建立了合作关系，建成了“陕西师范大学生物多样性研究实习基地”“西北农林科技大学实践教学基地”“西北濒危药材资源开发国家工程实验室化龙山药用植物资源保育基地”“安康学院教学科研基地”，为科研教学、人才培养搭建了良好平台。